Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Clip4Q8CI96 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Clip4Q8CI96 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip4Q8CI96 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Clip4Q8CI96 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Clip4Q8CI96 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip4Q8CI96 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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