Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms