Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms