Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp20Q8C6M1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp20Q8C6M1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp20Q8C6M1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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