Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms