Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3Q9

Casp9, Caspase-9, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp9Q8C3Q9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp9Q8C3Q9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Casp9Q8C3Q9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Casp9Q8C3Q9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp9Q8C3Q9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms