Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Atg16l1Q8C0J2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Atg16l1Q8C0J2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Atg16l1Q8C0J2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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