Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Snx16Q8C080 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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Snx16Q8C080 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Snx16Q8C080 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms