Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm19337-201ENSMUST00000218100 1584 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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