Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx17Q8BVL3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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