Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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