Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms