Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf41Q8BH75 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf41Q8BH75 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf41Q8BH75 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf41Q8BH75 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rnf41Q8BH75 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf41Q8BH75 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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