Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms