Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms