Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms