Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll4Q80UG8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms