Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms