Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TwistnbQ78WZ7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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