Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme8Q715T0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms