Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms