Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad54bQ6PFE3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rad54bQ6PFE3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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