Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trim37Q6PCX9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim37Q6PCX9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim37Q6PCX9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim37Q6PCX9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim37Q6PCX9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim37Q6PCX9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim37Q6PCX9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim37Q6PCX9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim37Q6PCX9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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