Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms