Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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