Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,026 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms