Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atg9aQ68FE2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atg9aQ68FE2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atg9aQ68FE2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atg9aQ68FE2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atg9aQ68FE2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atg9aQ68FE2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atg9aQ68FE2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atg9aQ68FE2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atg9aQ68FE2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Atg9aQ68FE2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Atg9aQ68FE2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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