Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf2Q64705 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf2Q64705 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf2Q64705 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf2Q64705 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf2Q64705 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf2Q64705 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf2Q64705 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf2Q64705 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf2Q64705 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf2Q64705 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf2Q64705 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf2Q64705 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms