Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms