Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Defa17Q64016 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Defa17Q64016 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Defa17Q64016 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Defa17Q64016 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Defa17Q64016 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Defa17Q64016 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Defa17Q64016 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Defa17Q64016 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Defa17Q64016 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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