Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms