Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ecm1Q61508 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ecm1Q61508 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ecm1Q61508 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ecm1Q61508 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ecm1Q61508 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ecm1Q61508 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ecm1Q61508 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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