Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde3bQ61409 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms