Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms