Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a4Q60857 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms