Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HellsQ60848 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms