Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cnot7Q60809 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cnot7Q60809 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Cnot7Q60809 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Cnot7Q60809 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Cnot7Q60809 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Cnot7Q60809 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Cnot7Q60809 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Cnot7Q60809 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Cnot7Q60809 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot7Q60809 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Cnot7Q60809 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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