Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms