Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms