Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms