Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms