Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc85aQ5SP85 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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