Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms