Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Trappc1Q5NCF2 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Trappc1Q5NCF2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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