Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf3Q5HZG4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms