Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GpkowQ56A08 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GpkowQ56A08 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms