Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256.2 ms