Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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Usp48Q3V0C5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Usp48Q3V0C5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Usp48Q3V0C5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms