Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms