Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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